基因组学与应用生物学

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《基因组学与应用生物学》 关注(): 期刊周期：双月刊; 期刊级别：北大核心; 国内统一刊号：45-1369/Q; 国际标准刊号：1674-568X; 主办单位：广西大学; 主管单位：广西大学; 查看基因组学与应用生物学近十年数据入口>>>; 上一本期杂志：《遗传》生物医学论文发表; 下一本期杂志：《生理学报》医生评职称论文发表

　　【杂志简介】

　　《基因组学与应用生物学》为基因组时代的理论与应用生物学提供服务的科学杂志,将面向基因组学、分子遗传学、生化与分子生物学等基础学科领域，着重刊登农林科学、医药科学、动物科学、环境、生态领域的研究成果。

　　【收录情况】

　　国家新闻出版总署收录

　　该刊被以下数据库收录：CA 化学文摘(美)(2009)、Pж(AJ) 文摘杂志(俄)(2009)、中国科学引文数据库(CSCD—2008)

　　核心期刊：中文核心期刊(2008)

　　期刊荣誉：中科双效期刊、Caj-cd规范获奖期刊

　　【栏目设置】

　　主要栏目：综述与专论、研究论文、研究报告、实验技术。

　　杂志优秀目录参考：

　　RASSF6在结直肠癌中的表达研究陈尔飞;贺红娟;刘瑞涛;王檬;杨进1357-1360

　　基于沙眼衣原体ompl基因限制性片段长度多态性和测序法用于女性生殖道感染沙眼衣原体基因分型陈煜岊;邓国明;徐鹏;杨岚;陈静;蒋燕明1361-1366

　　人小细胞肺癌细胞株中CNDP2的检测及意义林星谷;陈迎春;韦艳萍;龙骏;姚姿婷1367-1371

　　葡萄糖转运蛋白的转运机制研究江诚;谢俊;陈海峰1372-1377

　　人CCR1蛋白真核表达载体在稳转细胞中的构建及其鉴定白靖琨1378-1383

　　一名肥胖儿童营养干预后肠道内假小链双歧杆菌碳水化合物利用能力的探究吴欢;王睿瑞;赵宇峰;庞小燕;申剑;张晨虹1384-1391

　　新余市CRF01-AE亚型人类免疫缺陷病毒的分子流行病学及其抗病毒治疗的研究潘虹;刘芳宇;周银古;晏火兰;毛尚根;付小园;丁勇1392-1397

　　不相容双质粒共表达霍乱毒素类似嵌合蛋白周小芬;林卫萍;何华红;李想;张焜;杜志云;王华倩1398-1405

　　牦牛和水牛全基因组微卫星分布规律及其比较分析戚文华;蒋雪梅;杜联明;肖国生1406-1412

　　关岭牛MyoD基因原核表达载体的构建及生物信息学分析夏丹;许厚强;陈伟;陈祥;周迪;张雯;桓聪聪;赵焕平;张青青;孙成娟1413-1420

　　马氏珠母贝组蛋白H3基因的克隆与表达特性分析潘晓艳;郑哲;田荣荣;焦钰;杜晓东1421-1428

　　微波辅助CDA酶法制备烹饪后龙虾壳聚糖及初步表征窦勇;胡佩红;顾鹏程;沈媛媛1429-1434

　　砂藓ATP合酶Ⅱ亚基基因的克隆及表达分析周伯;沙伟;张梅娟;张春蕾;索荔1435-1442

　　十字花科黑腐病菌中一个与HR反应相关的小RNA的鉴定李良贤;肖波;黄晓韵;唐东阶1443-1450

　　锻压技术期刊投稿：炼铁技术系统的物质流与能量流探讨

　　摘要：本文从炼铁系统的物质流和能源流两个方面出发，对炼铁系统所消耗的能源和资源情况进行了详细分析。

　　【关键词】炼铁系统,物质流,能源流

　　近年来，全球气温开始变暖，对自然环境和人类生活造成了严重影响。钢铁行业生产和运行的过程中所产生的能源消耗，废弃排放是致使全球气温升高的主要原因，因而受到了社会的广泛关注。钢铁联合企业中，炼铁系统的能耗和二氧化碳的排放对气温影响最为严重。碳素是炼铁系统消耗的主要能源，而碳素在燃烧过程中会释放大量CO2。因此，为了保证人类拥有健康美好的生活环境，为了建设节约型社会，必须提高炼铁系统的能源效率。

　　基因组学与应用生物学最新期刊目录

碱基编辑系统开发及应用进展————作者：周方方;史远远;黄佳颖;

摘要：单核苷酸变异是基因组中常见的变异形式，对生命健康、农艺性状等有关键影响，开发单核苷酸基因编辑工具可有效实现疾病治疗、农业育种等重要应用。碱基编辑系统作为一种新型基因编辑技术，能够在不引起DNA双链断裂且无需供体DNA的情况下，实现基因组单碱基的精确编辑，从而规避了传统CRISPR/Cas9系统可能带来的细胞毒性问题。本文系统总结了碱基编辑系统的多种类型及其应用范畴，深入探讨了碱基编辑系统在效率、特...

跨膜前后轴转换1蛋白结构及其在视神经发育中的功能研究————作者：邓蓓;王萌;段宝珍;孙增先;董淑波;侍慧慧;

摘要：为探讨跨膜前后轴转换1（transmembrane anterior-posterior axis transition 1，TAPT1）蛋白的功能及其在视神经发育中的调控机制，本研究应用ProtParam、SOPMA、Phyre 2.2、SMART等在线分析预测网站对TAPT1蛋白进行生物信息学分析，解析该蛋白的基本结构。同时，以斑马鱼（Danio rerio）为模式动物，通过原位杂交技术构建t...

CRISPR-Cas核酸酶家族的系统分类及挖掘方法研究进展————作者：李百涛;郑越;

摘要：CRISPR-Cas系统是细菌、古菌以及噬菌体抵抗外源核酸入侵的一种适应性免疫系统，在真核细胞基因组编辑中具有广泛应用，并在基础科研、遗传病治疗、动植物育种等领域取得了重要成果。伴随着基于序列或结构的挖掘方法的不断开发和迭代，科学家们从原核生物基因组数据库及环境宏基因组数据库中鉴定出了一系列编辑特性丰富、适用于不同编辑场景需求的CRISPR-Cas家族，极大地扩充了可用的基因编辑工具箱。目前，已鉴...

可诱导的CRISPR-dCas9基因表达调控策略与方法————作者：王清灏;曹浩博;吴雨璇;李逸豪;

摘要：CRISPR系统作为一种高效、精确的基因编辑工具，已被广泛应用于基因功能研究、疾病治疗和生物技术开发。近年来，通过改造CRISPR系统，尤其是dCas9蛋白和sgRNA，研究人员开发出多种基因表达调控策略。其中可诱导的CRISPR基因表达调控系统通过整合外部刺激响应元件(如光、化学小分子、温度等)，实现了对基因表达的时间和空间精准控制。本文综述了基于CRISPR系统的基因表达调控策略与方法的最新进...

CRISPR/Cas9、单碱基编辑器和引导编辑器治疗β-血红蛋白遗传病的进展与挑战————作者：支胜尧;罗晓彤;

摘要：β-地中海贫血和镰状细胞病是由β珠蛋白基因突变引起的两种常见单基因遗传病。它们的显著特征是血红蛋白合成异常，造成患者终身定期输血维持生命，并伴随多种并发症。异体造血干细胞移植（hematopoietic stem cell transplantation， HSCT）是主要的治愈血红蛋白遗传病的临床策略。然而，由于人类白细胞抗原（human leukocyte antigen， HLA）配型相合供...

CRISPR技术介导的基因转录调控及表观修饰————作者：王峻峰;张毅;

摘要：成簇规律间隔短回文重复序列（clustered regularly interspaced short palindromic repeat， CRISPR）技术自问世以来，因其操作的简易性和多功能性，在基因编辑领域引发了革命性的变化。除了基因定点敲除、插入或替换，CRISPR技术还被改造并应用于其它研究领域，如基因转录调控、表观遗传修饰等。本文首先对CRISPR技术的分类和作用原理进行概述，然后...

新疆四爪陆龟线粒体基因组特征与系统发育分析————作者：王伟亮;陈奉欣;刘开平;李村院;胡圣伟;倪伟;

摘要：四爪陆龟（Testudo horsfieldii）自1973年在我国新疆伊犁地区发现以来，由于其珍稀性与中生代孑遗地位而引起关注，但分子生态学研究仍较匮乏。本文针对新疆四爪陆龟，参照土库曼斯坦种群线粒体基因组序列（NC＿007697），设计26对特异引物并进行了PCR扩增，采用Sanger测序获取完整线粒体基因组（16 917 bp）。结果显示，基因组A+T含量达60.55%，呈显著AT偏倚，含1...

RNA病毒载体介导的植物基因组编辑研究进展————作者：张燕;陈军;崔凯;吉万全;李停栋;

摘要：基因组编辑技术在植物育种和功能基因研究中发挥重要作用，但限制基因组编辑在植物上应用的一个关键因素是遗传转化困难或效率较低。目前最常用的农杆菌（Agrobacterium）或基因枪介导植物遗传转化方法需要复杂组织培养和再生的过程，并且在进行基因编辑时往往要先通过筛选获得转基因植株，然后再进行突变体鉴定。近年来，RNA病毒载体作为一种新兴的植物基因组编辑递送工具，在本氏烟草（Nicotiana ben...

不同品种及管理方式葡萄根际土壤微生物群落结构和功能比较分析————作者：黄松林;丁卓然;徐小龙;王博;陈玲玲;

摘要：葡萄（Vitis）是一种广泛种植的果树，具有多样化的用途和重要的经济价值。植物土壤微生物群落对植物的生长发育至关重要，本研究基于细菌核糖体RNA（16S rRNA）和真菌内部转录间隔区（internal transcribed spacer， ITS）扩增子测序技术对同一地区不同品种葡萄和百香果（Passiflora）根际土壤微生物的结构和功能进行了比较，分析不同品种葡萄和百香果根际土壤微生物群落...

基于转录组分析锌指转录因子ZFP1在滇黄精根腐致病尖孢镰刀菌生长中的调控机制————作者：李怡萌;王景怡;唐晶莹;苏建云;董家红;季鹏章;张磊;

摘要：为探索锌指转录因子ZFP1（zinc finger transcription factor ZFP1）在滇黄精（Polygonatum kingianum）根腐致病尖孢镰刀菌（Fusarium oxysporum）菌丝生长、孢子产生和致病力中的作用机制，本研究对尖孢镰刀菌野生型菌株WT＿Fo、ZFP1基因缺失菌株DEL＿Fo和回补菌株COM＿Fo进行转录组测序分析。结果表明，DEL＿Fo和WT＿...

基于图注意力网络(GAT)的单细胞类型注释方法研究————作者：孙熠伟;徐淑坦;

摘要：单细胞转录组测序（single-cell RNA sequencing， scRNA-seq）在揭示细胞异质性方面具有重要意义，但现有细胞类型注释方法存在着跨物种适应性、泛化性、类别不平衡等问题。本文提出了一种基于图注意力网络（graph attention network， GAT）的细胞类型注释方法——ScLabeler。该方法通过结合类别均衡优化策略和图注意力机制，增强了细胞间的复杂关系的捕...

低氧胁迫对青海湖裸鲤鳃组织中免疫相关基因表达的影响————作者：马淑兄;贾春艳;王璐;霍柯帆;陈艳霞;李瑾;祁洪芳;刘扬;金文杰;

摘要：低氧是鱼类在水体环境中生存时经常面对的问题之一，其对鱼体免疫调节能力有至关重要的影响。为探究低氧胁迫对青海湖裸鲤（Gymnocypris przewalskii）免疫调节能力的影响，本研究以转录组学分析为基础，探讨低氧胁迫下鳃组织中免疫相关基因的表达情况。选取1龄期的青海湖裸鲤经低氧胁迫0、30、40和50 min后，取鳃组织进行转录组测序分析。对比分析空白对照组与3个低氧胁迫组之间基因的差异表达...

无乳链球菌母源毒株HN016和弱毒株YM001感染罗非鱼血液代谢组学变化的初步研究————作者：苏美珍;易丹丹;韦信贤;雷爱莹;杨彦豪;童桂香;覃幼洁;谭红连;何鑫;李莉萍;

摘要：本研究旨在探讨无乳链球菌（Streptococcus agalactiae）母源毒株HN016与弱毒株YM001对罗非鱼血液代谢组的影响，以期为乳链球菌感染机制及弱毒株YM001疫苗免疫机制的研究提供理论基础。运用液相色谱-串联质谱法技术测定罗非鱼（Oreochromis niloticus）血液中代谢物，并通过主成分分析（Principal Component Analysis， PCA）和偏最...

一体两翼五核心“五有”领军型人才培养体系建设探索——以涉农学院为例————作者：司红彬;沈水宝;

摘要：在当今全球化竞争激烈的背景下，领军型人才对国家和社会进步至关重要。广西大学致力于“双一流”建设，旨在培养具有社会责任、法治意识、创新精神、实践能力与国际视野的“五有”领军型人才。针对综合性大学中新农科师资力量薄弱、产教融合不足、人才评价体系固化等问题，本文提出构建“一体两翼五核心”人才培养体系：以产学研融合为主体，强化科学合理的评价体系与高素质师资队伍为两翼；通过学生入企、引企驻校等措施聚焦培养学...

杉木ClMYB5基因cDNA的克隆、表达特性与互作蛋白研究————作者：李翠萍;张子健;文娅婷;徐增富;李魁鹏;

摘要：杉木(Cunninghamia lanceolata)是我国南方主要的用材树种，具有广泛的用途。MYB转录因子家族在植物的生长、发育、非生物胁迫应答以及类黄酮生物合成等方面起到重要的调控作用。本研究克隆了与拟南芥(Arabidopsis thaliana)AtMYB5基因同源的杉木ClMYB5基因cDNA,对其进行生物信息学、表达特性及互作蛋白分析。生物信息学分析结果显示，ClMYB5蛋白为既亲水...

全基因组关联分析鉴定水稻中细菌性条斑病的抗性位点————作者：杨梅;牛鹏威;陈美伶;陈福平;陈曼妮;岑卫健;罗继景;

摘要：由革兰阴性菌水稻黄单胞菌(Xanthomonas Campestris pv.oryzae, Xoc)引起的细菌性条斑病(bacterial leaf streak, BLS)是水稻生产区最具破坏性的病害之一，尤其是在潮湿的热带、亚热带地区。本研究通过对152份不同水稻(Oryza sativa)种质进行细菌性条斑病的抗性表型鉴定，并结合SNP数据进行全基因组关联分析(genome-wide as...

秦巴野桑蚕(Bombyx mandarina)基因组测序组装与蛹滞育时期的全基因组甲基化分析————作者：孟刚;楚渠;王瑞娴;杨金宏;张笙源;陈安利;吕婷;彭云武;凌君;

摘要：为研究野桑蚕(Bombyx mandarina)全基因组甲基化特性及蛹滞育与基因组DNA甲基化关系，本研究首先测序组装了秦巴野桑蚕基因组，在此基础上对不同时期的蛹滞育材料进行基因组甲基化测序，分析DNA甲基化特征，鉴定差异甲基化区域及相关基因。结果表明，秦巴野桑蚕基因组大小为457.85 Mb,蛋白编码基因12 280个，rRNA、 sRNA、 tRNA分别为158、 6 951和778个，同时鉴...

基因组学与应用生物学作者投稿指南

摘要：<正>1刊登范围本刊主要刊登植物、动物和微生物基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学等组学,分子医学、现代生物技术等应用生物学研究的未发表的创新性研究成果,以及上述领域的综述论文。2栏目设置本刊设置固定栏目和随机栏目。固定栏目常设研究论文,发表最新的原始研究成果。随机栏目根据稿源设述评及其他栏目

基因组学与应用生物学论文撰写指南

摘要：<正>一、栏目设置本刊设置固定栏目和随机栏目。固定栏目常设研究论文,发表最新的原始研究成果。随机栏目根据稿源设述评及其他栏目。二、论文写作的基本要求1题目与标题论文题目要紧扣主题,务求简明、新颖,有足够的信息,能引起读者的兴趣,不用副标题,一般不宜超过25个汉字或英文单词。应使用标准术语、学名全称、药物和化学品通用名称,不宜使用广义术语、夸张词语等,同时避免在题目中使用不常用的缩写词

适应喀斯特与非喀斯特生境的两种天葵属植物的基因组特征研究————作者：莫晓芫;张强;黄夕洋;吴磊;覃信梅;

摘要：为探索适应不同生境基质植物基因组特征变异规律，本研究以生长在喀斯特石灰岩上特有种广西天葵（Semiaquilegia guangxiensis）和与之近缘且主要生长在泥土上的广布种天葵（Semiaquilegia adoxoides）为研究对象，利用流式细胞术和基于二代测序的基因组Survey分析，评估基因组大小、杂合率、重复序列、 GC含量和倍性，比较和分析基因组特征差异。流式细胞术预估广西天葵...

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