基因组学与应用生物学最新期刊目录
乙型肝炎肝硬化患者的尿液代谢组学特征的研究————作者：卢琳;林洪升;李明芬;鲁晓航;吴和孟;
摘要：乙型肝炎肝硬化是由乙型肝炎病毒长期感染引起的一种慢性肝脏疾病，通常是乙型肝炎发展的严重后果。本研究通过分析乙型肝炎肝硬化患者的尿液代谢组学特征，旨在寻找潜在的代谢标志物，为乙型肝炎肝硬化患者的早诊早治提供依据。采用液相色谱-串联质谱代谢组学技术检测乙型肝炎肝硬化患者和健康体检人群的尿液代谢物，研究代谢组学特征、鉴定差异表达的代谢物，并分析其与疾病进展的关联。共筛选出229种组间差异代谢物，包括21...
整合基因芯片及动态尿液代谢组学筛选肠上皮化生的生物标志物————作者：任贤芳;王玥;于舒婷;秦雪梅;胡英还;
摘要：通过整合高通量基因表达数据库（gene expression omnibus， GEO）中临床胃组织基因芯片数据与大鼠（Rattus norregicus）多时段尿液代谢组学分析，筛选并验证肠上皮化生（intestinal metaplasia， IM）相关的尿液生物标志物。首先采用R语言分析临床胃炎到IM的差异表达基因（differentially expressed genes， DEGs）并...
基于组学数据鉴定冠心病合并抑郁症关键基因及潜在用药分析————作者：郑春成;孔鹏云;张齐;邓真麟;杨力强;曾清清;
摘要：本研究旨在运用转录组学数据方法鉴定冠心病合并抑郁症（coronaryheartdiseasecombinedwithdepressivedisorder，CHD-DD）的关键基因及诊断性生物标志物，并分析调控关键基因治疗CHD-DD的潜在药物。从GEO数据库获取冠心病（coronaryheartdisease，CHD）和抑郁症（depressivedisorder，DD）相关数据集（GSE4214...
不同茯苓菌株种质资源遗传多样性分析————作者：温家敏;吴民深;张荣澳;程飞;
摘要：茯苓（Wolfiporia cocos）是我国著名的药用真菌，遗传多样性的系统研究有助于丰富种质资源库和开展种质创新工作。本研究以16株不同来源的茯苓菌株为研究对象，利用LSU和TEF1-α引物进行序列扩增，使用MEGA11.0软件进行多重序列比较和系统发育进化树构建，同时辅以拮抗实验进一步验证，分析不同茯苓菌株的遗传多样性。结果表明：16株茯苓菌株的LSU序列长度为974～984 bp，碱基G+...
不同原噬菌体类型的柑橘黄龙病菌株的致病症状差异及转录组分析————作者：黄文霞;郑永钦;许鹏彬;谢素金;郑正;邓晓玲;
摘要：柑橘（Citrus）黄龙病（Huanglongbing， HLB）主要由黄龙病菌（Candidatus Liberibacter asiaticus， CLas）引起，在世界范围内广泛分布，通过柑橘木虱（Diaphorina citri）和嫁接等方式传播。早期研究发现，携带不同原噬菌体类型的黄龙病菌株的增殖速率和致病力有所差异。本研究通过在田间采集的黄龙病症状的冰糖橙（Citrus sinensi...
肠道菌群驱动免疫及代谢通路调控克隆性造血的生物学机制探讨————作者：钟锦漫;许芸嫚;何月平;陈嫦;谭洁文;熊丹;
摘要：克隆性造血（clonal hematopoiesis, CH）与炎症介质和代谢过程的失调有关，而肠道菌群在调节代谢物和免疫介导的炎症方面起着关键作用。本研究使用孟德尔随机化（Mendelian randomization, MR）分析方法，探究肠道菌群通过细胞因子、免疫细胞和代谢物影响CH的因果机制。基于大规模全基因组关联研究数据，开展两样本MR分析，评估211种肠道菌群、 41种细胞因子、 73...
基于动物实验和转录组学探究加味七方胃痛颗粒阻断大鼠胃“炎癌转化”的作用机制————作者：熊常州;古文姝;方以峻;陈鑫源;王婷;崔引航;陈文隆;唐梅文;
摘要：本研究旨在探讨加味七方胃痛颗粒阻断胃癌前病变(precancerous lesions gastric cancer, PLGC)“炎癌转化”的分子机制，明确其对胃癌前病变的调控作用。本研究通过复合造模法构建PLGC大鼠(Rattus norregicus)模型，随机分为对照组、模型组、维酶素组及中药组。采用HE染色法评估胃黏膜病理学改变，采用免疫组织化学技术检测p53、 Ki-67蛋白表达；通过...
基因组学与应用生物学作者投稿指南
摘要：<正>本期刊主要刊登植物、动物和微生物基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学等组学，分子医学、现代生物技术等应用生物学研究的未发表的创新性研究成果，以及上述领域的综述论文。1投稿要求和注意事项1.1电子文稿本刊采用计算机排版，只接受电子文稿，请作者通过本刊在线投稿平台(https://gxnb.cbpt.cnki.net)投稿。作者提供的文件格式为word文件，图形部分可为jpg等图...
基于COⅠ基因分析长江中下游陈氏新银鱼群体遗传多样性————作者：袁佳;方弟安;刘宝兴;李天佑;赵华丽;尤洋;
摘要：长江中下游地区生境多样，是陈氏新银鱼（Neosalanx tangkahkeii）的核心分布区域。为深入了解不同生境下陈氏新银鱼的遗传多样性和遗传分化情况，本研究利用线粒体细胞色素c氧化酶Ⅰ（cytochrome c oxidaseⅠ,COⅠ）基因序列作为遗传标记，对来自长江中下游泰州（Taizhou, TZ）、南京（Nanjing, NJ）、安庆（Anqing, AQ）、湖口（Hukou, HK...
基因组编辑技术的优化发展及其在底盘细胞改良与代谢工程中的应用————作者：姜康佳;马涌洁;许景博;杜平州;郭亮;胡金远;
摘要：基因组编辑技术利用核酸酶对特定基因序列进行特异性切割，随后借助细胞内的自然修复机制，实现对基因的定向编辑。基因编辑技术经过不断地开发与改造，向着特异性更强、操作效率更高、适用性更广泛的方向发展。对于CRISPR/Cas(clustered regularly interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated protein)系统的开发拓...
基因组学与应用生物学作者投稿指南
摘要：<正>本期刊主要刊登植物、动物和微生物基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学等组学,分子医学、现代生物技术等应用生物学研究的未发表的创新性研究成果,以及上述领域的综述论文。1投稿要求和注意事项1.1电子文稿本刊采用计算机排版,只接受电子文稿,请作者通过本刊在线投稿平台(https://gxnb.cbpt.cnki.net)投稿。作者提供的文件格式为word文件,图形部分可为jpg等图...
CRISPR技术介导的基因转录调控及表观遗传修饰————作者：王峻峰;张毅;
摘要：成簇规律间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeat, CRISPR)技术自问世以来，因其操作的简易性和多功能性，在基因编辑领域引发了革命性的变化。除了基因定点敲除、插入或替换，CRISPR技术还被改造并应用于其他研究领域，如基因转录调控、表观遗传修饰等。本文首先对CRISPR技术的分类和作用原理进行了概述，然...
植物DNA损伤修复及基因组编辑应用进展————作者：张志翔;喻思媛;沈卓凡;姜昊;王升星;
摘要：近年来，植物基因组编辑技术取得显著进展，但依然存在效率与精准性不足的问题，DNA损伤修复机制差异是其中潜在因素。包括CRISPR/Cas核酸酶系统、碱基编辑系统及引导编辑系统在内的可编程序列特异性修饰工具可被定向引导至特定染色体DNA序列上并产生损伤(双链断裂、碱基替换等)。而这些序列突变在细胞内会被进一步识别并启动修复，从而产生不同的突变结果，这主要受宿主DNA损伤类型及DNA修复机制的影响。本...
CRISPR/Cas系统在核酸检测中的研究进展————作者：王晓艳;秦朗;马琳莎;林秋鹏;
摘要：高效、灵敏、实用的核酸检测传感器对推动核酸检测及诊断行业发展具有重要意义。规则成簇的间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats, CRISPR)/CRISPR相关蛋白(CRISPR-associated protein, Cas)系统具有特异性地识别核酸序列，并通过附属切割活性放大信号的特性，已经被开发成了...
吡非尼酮通过降低乳腺癌细胞外基质沉积增加CD8+ T细胞的浸润————作者：王双;包逸雯;胡祖权;王赟;刘鲜梅;曾柱;
摘要：本研究旨在探讨吡非尼酮（pirfenidone， PFD）能否通过降低乳腺癌细胞外基质（extracellular matrix， ECM）的沉积，从而改善其免疫微环境。本研究通过构建4T1乳腺癌模型并随机将其分为：模型对照组（PBS灌胃处理）与治疗组（PFD灌胃治疗）。采用马松染色和天狼星红染色检测肿瘤纤维化程度，原子力显微镜检测肿瘤组织硬度，免疫荧光染色检测肿瘤组织中CD8+ 整合多源转录组数据与机器学习挖掘阿尔茨海默病特征基因————作者：朱奕霖;于田;李婷婷;杜文龙; 摘要：本研究旨在基于多源转录组数据与机器学习算法，筛选出能准确识别阿尔茨海默症（Alzheimer's disease， AD）的特征基因并构建竞争性内源RNA（competing endogenous RNAs， ceRNA）调控网络，揭示其在AD病例进程中的表达机制。通过整合GEO数据库中AD人脑组织转录组数据（训练集：GSE37263、GSE122063、GSE138260；验证集：GSE5281... 槐豆木虱雌雄成虫转录组及气味结合蛋白基因家族分析————作者：杨清川;叶婷玉;古力努尔·吐尔洪;孙兵营;范雨燕;肖海兵;杨明禄; 摘要：为阐明槐豆木虱(Cyamophila willieti)雌雄成虫基因表达差异及其化学感受机制，本研究通过转录组测序分析雌雄成虫基因表达谱，并聚焦气味结合蛋白(odorant binding proteins，OBPs)基因家族的功能特征。本研究通过转录组测序，构建了槐豆木虱雌雄成虫转录组数据库，对其unigenes 的功能注释、分类，差异表达、GO富集等进行分析，并挖掘槐豆木虱雌雄成虫中潜在的OB... 日本青鳉Gsdf-Aurka信号调控减数分裂前期生殖细胞雌雄分化的潜在分子机制————作者：陈娟;李晨杰;余世琦;关桂君; 摘要：日本青鳉(Oryzias latipes)性腺体细胞衍生因子(gonadal soma-derived factor，gsdf)缺失导致生殖细胞囊性分裂过度增殖和精母细胞中心粒复制异常。为探究gsdf信号如何影响细胞增殖和中心粒复制，本研究利用实时荧光定量PCR（real time fluorogenic quantitative PCR）和免疫荧光检测等方法，分析了极光激酶A(aurora ki... 贝莱斯芽孢杆菌在豆豉发酵中的风味物质及全基因测序分析————作者：叶桦清;杨林;王筱兰; 摘要：本研究从曲霉型（Aspergillus）豆豉（Douchi）中筛选分离出一株新的菌株——贝莱斯芽孢杆菌（Bacillus velezensis）JXNUWXY23，该菌在豆豉发酵过程中发挥着关键作用，能够有效降解纤维素并形成风味物质。为了研究其代谢机制，对该菌株产生的挥发性风味物质进行气相色谱-质谱联用技术（gas chromatography-mass spectrometry，GC-MS）测定... 基于响应面法的嗜虫耶尔森氏菌CSLH88发酵培养基优化————作者：柯思恺;齐欢;郑昀枫;余伟;张飞萍;吴松青; 摘要：松材线虫病（pine wilt disease）是一种全球性的重大森林病害，其病原体为松材线虫（Bursaphelenchus xylophilus）,该病对我国的林业经济和生态系统构成了严重威胁。松墨天牛（Monochamus alternatus）是该病害的主要传播媒介，而嗜虫耶尔森氏菌（Yersinia entomophaga）对其具有杀虫活性。培养嗜虫耶尔森氏菌对于防治松墨天牛和维护生态安... 基因组学与应用生物学来自网友的投稿评论： 初审1个月，复审不到2个月，都是3个多月给出采用结果，基因组学与应用生物学杂志的论文格式一定要清晰，基本上不会有什么问题。审稿意见都比较正面，也有些无关紧要的问题，给审稿人良好的印象显然会增加录用概率。 该期刊为北大核心、CSCD核心期刊，收稿和审稿速度较快。从今年8.31日投稿到录用不到2个月的时间，可以反映出该期刊处理稿件效率很高。其次，在审稿过程中，审稿专家专业的点评和主编老师专业的修改要求，使我的论文质量有了很大提升，既有挑战，更是学习。另外，在修稿过程中编辑部老师非常认真负责，打电话发邮件都能及时回复，并总是耐心地解答所有问题。最后，校稿时主编特别认真地调整了我文章的各种字体、表格以及标点符号。无论是严谨专业的态度、专业知识的理解还是言语措辞的功底都令我受益匪浅。总之，期刊处理稿件速度很快，编辑老师认真负责，才使此次投稿非常顺利！最后，祝《基因组学与应用生物学》期刊越办越好！
奔跑的辣椒酱
画个圈圈兜住幸福
