北京大学学报(自然科学版)杂志期刊荣誉

　　·1995年7月获北京市高校系统自然科学学报“三优”评比一等奖;11月获国家教委“全国高校自然科学学报系统优秀学报二等奖”

　　·1996年11月获国家教委“国家教委系统优秀科技期刊一等奖”

　　·1997年3月获中宣部、新闻出版署、国家科委联合颁发的“第二届全国优秀科技期刊一等奖”

　　·1999年5月获教育部“全国高校优秀科技期刊一等奖”

　　·1999年10月获首届“国家期刊奖”

　　·2001年11月经新闻出版总署和科技部等有关部委选定, 进入国家“期刊方阵”中最高一层的“双高”(高水平、高知名度)期刊阵列, 成为教育部主管的综合性大学自然科学学报唯一入选者

　　·2002年12月获第二届“国家期刊奖”提名奖

　　·2004年9月获教育部“全国高校优秀科技期刊一等奖”

　　·2005年1月获第三届“国家期刊奖”提名奖

　　·2009年获中国期刊协会“新中国60年有影响力的期刊”奖

　　·2010年12月获第二届中国出版政府奖期刊奖提名奖

　　·2010年以来历年获得教育部科技发展中心“中国科技论文在线优秀期刊”一等奖

　　·2006年以来获教育部历届“中国高校精品期刊奖”和“中国高校杰出科技期刊奖”

　　·入选中国科学技术信息研究所历届“中国精品科技期刊”

　　·2005年以来19次入选中国科学技术信息研究所“百种中国杰出学术期刊”

　　·2024年入选中国科技期刊卓越行动计划二期“中文领军期刊”项目