ISSN和CN都属于是期刊号，不过概念不同，CN刊号在国内发行的连续出版物(期刊、杂志、报纸等)必须有国家有关部门颁发的CN刊号。否则视为非法出刊。国外的期刊、杂志、报纸等要进入国内发行，也必须先取得CN刊号才可以。
ISSN刊号，国际连续出版物(期刊、杂志、报纸等)的发行，必须获得国际认可的ISSN刊号。通过各国的连续出版物都会获得ISSN刊号。不过一些不在国内发行的刊物通常没有CN刊号，但会有ISSN刊号。部分重要的国际学术刊物，通常只有ISSN刊号，却没有CN刊号。也就是说CN刊号是中国的发行通行证。
ISSN由于是国际刊号，所以在国际上都是通用的，而CN刊号则是只适用于国内学术期刊。但是在国内的正规的刊物上都是要具备ISSN刊号和CN刊号的。因此ISSN刊号的获取就相对容易的多，所以一些非法刊物只有ISSN而没有CN，因为非法刊物无法通过严格的审核，所以我们辨别刊物是否正规的时候，主要还是要看CN。
